Las auditorias internas previas a las auditorias de certificación son una herramienta esencial para incrementar la confianza en los de productos certificados, ya que permiten corregir fallos a tiempo para que no se vea comprometida la certificación. Aunque son convenientes en todos los casos, son obligatorias para obtener las certificaciones ISO 9001:2015 (apartado 9.1.2), GLOBALGAP o ISO 17065:2012 (apartado 8.6).
Con frecuencia estas auditorias tratan de cubrirse con personal propio de la organización, pero su independencia se ve comprometida por diferentes razones: su participación en las actividades auditadas, presiones de la dirección, relaciones de amistad o enemistad con otros miembros, conocimiento limitado de determinadas áreas, etc. lo que limita en gran medida sus resultados. Por contra, cuando son realizadas por equipos auditores expertos e independientes a la organización o la certificadora se evitan estos inconvenientes, permitiendo además obtener un asesoramiento especializado y detectar oportunidades de mejora
Con frecuencia estas auditorias tratan de cubrirse con personal propio de la organización, pero su independencia se ve comprometida por diferentes razones: su participación en las actividades auditadas, presiones de la dirección, relaciones de amistad o enemistad con otros miembros, conocimiento limitado de determinadas áreas, etc. lo que limita en gran medida sus resultados. Por contra, cuando son realizadas por equipos auditores expertos e independientes a la organización o la certificadora se evitan estos inconvenientes, permitiendo además obtener un asesoramiento especializado y detectar oportunidades de mejora